4

JBrowse 安装方式

 3 years ago
source link: https://segmentfault.com/a/1190000038544936
Go to the source link to view the article. You can view the picture content, updated content and better typesetting reading experience. If the link is broken, please click the button below to view the snapshot at that time.

在window环境下安装

  • cmd
  • Node.js 10.4+

首先是安装 node ,在网络上有很多这样的教程,如果你还有额外的对于node版本的控制需求,可以使用 nvmnode 版本进行下载和选用。
在其中可能需要用到一些其他的软件:比如 Git

step1:全局或局部安装 jbrowse :1、全局: npm install -g @jbrowse/cli 2、局部: npx @jbrowse/cli
step2:使用 jbrowse create 下载JBrowse 2:jbrowse create jbrowse2 , 还可以直接在 GitHub 下载相应的压缩包然后解压。

这个软件类似于一个网页,只不过需要使用者自己开启本地服务才能使用,因此只需要安装了node的机器,在安装了jbrowse的文件夹下输入 npx serve .


About Joyk


Aggregate valuable and interesting links.
Joyk means Joy of geeK