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HyperparameterHunter 3.0:一文教你学会自动化特征工程

 4 years ago
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欢迎使用 HyperparameterHunter 3.0。

Github地址:https://github.com/HunterMcGushion/hyperparameter_hunter

这一工具可以自动保存和优化特征工程步骤以及 超参数 ,让优化更加智能,并保证不浪费任何实验。

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把特征工程适应到 超参数 优化的 Pre-HyperparameterHunter demo

漫长的等待已经结束。HyperparameterHunter 3.0 (Artemis) 来了,它增加了对特征工程的支持,以下是一些新的特性。

  • 使特征工程的语法清晰化、可定制的函数列表。

  • 构建特征工程工作流的一致性框架,流程自动记录。

  • 特征工程步骤优化,包括对过去实验的检测,以进行快速启动优化。

  • 别再跟踪特征工程步骤的列表,以及它们与其他 超参数 一起工作的方式

背景

什么是特征工程?

很多人对特征工程和预处理都有不同的定义,那么 HyperparameterHunter 是如何定义它的呢?

「特征工程」是在模型训练之前对数据所做的任何修改——无论是在实验开始的时候所做的一次修改,还是在在每一轮交叉验证时所做的重复修改。从技术上讲,HyperparameterHunter 可以让用户自定义「特征工程」的细节。下面是「特征工程」定义下的一些可能的方法:

  • 手动特征创建

  • 缩放/归一化/标准化

  • 重采样 (参考我们的 imblearn 的例子)

  • 目标数据转换

  • 特征选择/消除

  • 编码(one-hot,标签等等)

  • 填补

  • 二值化/合并/离散化

还有其他相关的数据操作。

为什么应该关心特征工程?

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特征工程很少成为 超参数 优化中的一个话题。所以为什么要关系它呢?

首先,特征工程是很重要的。

你几乎总是需要预处理你的数据。这是一个必须的步骤。

其次,特征工程和 超参数 调参是一样的,只不过 超参数 可以手动调整。

在数据建模前,我们会遇到很多特征工程上的问题,比如说,应该使用 StandardScaler 还是 Normalizer?我们只能对这两者进行测试,尝试记住哪种对算法是最好的。相似的问题还有:应该使用 one-hot 来编码每周的日期吗?或者还是使用「是否是周末」的二值编码?需要考虑月份吗?年份呢?应该将十二个月转换成四季吗?闰年该怎么办?

但是归根接地,开发者所用的众多特征工程中实际上只是另一种需要优化的 超参数 而已——但是并没有工具去优化这些「 超参数 』,为什么呢?

这里有一个很好的理由:特征工程很难。它并不是在 0.1 到 0.7 之间挑一个数字,或者是选择使用 sigmoid 还是 ReLU 作为神经网络层的激活函数。这里讨论的是将数据处理的方式参数化,并优化一系列功能。这需要我们知道每个特征代表着什么,以及参数化后返回了什么结果——所有的这一切都是在转换宝贵的数据。

现在的特征过程可能是这样的:拼凑一个脚本文件去进行所有的特征工程,然后将这个脚本拖拽到其他项目中去。对于每个不同的项目粗暴地删除或者修改需要的部分。如果这样做的话,在项目结束的时候不可能重新创建所有的实验,因为实验中应用的特征工程没有清晰的、自动的记录。

此外,忽略特征工程会导致 超参数 优化结果不可信。确定地说,必须要有一个更好的方法,而现在,有了!

HyperparameterHunter 的方法

在介绍 HyperparameterHunter 如何自动化特征工程之前。我们首先看一下数据,然后提炼出特征工程的步骤。数据集是 SKLearn 的波士顿房价回归数据集。这个数据集具有可管理的 506 个样本,除了目标之外还有 13 个特征。

数据集地址:https://scikit-learn.org/stable/datasets/index.html#boston-house-prices-dataset

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基线模型

特征工程的目的是产生更好的模型,首先建立一个基线 CVExperiment,然后通过特征工程的方式逐渐提升模型的效果。和往常一样,首先设置环境来定义任务,以及评价结果的方法。

基线CVExperiment地址:https://hyperparameter-hunter.readthedocs.io/en/latest/api_essentials.html#experiment-execution

我们对 5 份数据做 K 重的交叉验证,只关注在绝对误差的中间值上。

此外,通过 SKLearn 的 train_test_split 函数可以从 train_dataset 提取出一个 holdout_dataset。

然后使用 AdaBoostRegressor 和它的默认参数运行一个简单的 CVExperiment 模型,这样可以看到没有特征工程时的结果。

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定义问题

现在已经建立了 0.51 的基线 MAE 用于 out-of-fold 预测,现在可以看一下用来超越这个基线的一些特征工程步骤。

A. 创建人工特征

因为人类是创造性的,我们喜欢使用特征工程做一些有趣的事情,所以可以把自定义的特征添加到输入数据中,首先,可以创建一个特征,它是由 13 个其他特征得到的欧几里得范数,或者我们可以定义ℓ2-norm!本着创新的精神,本文将欧几里得范数创新性地命名为 euclidean_norm

B. 输入缩放

接下来要进行一下输入缩放。认真地讲,对数据进行缩放通常是一个好主意。

别忘了对 train_inputs 做一下 fit_transform,但是只对的 non_train_inputs(validation/holdout data)做一下 transform,这样做是为了避免数据泄露(https://machinelearningmastery.com/data-leakage-machine-learning/)。

C. 目标转换

特征工程的最后一步是使用 SKLearn 的 QuantileTransformer 让目标输出均匀地分布,从而让最频繁出现的值分散开,并异常值的影响。与我们的输入缩放一样,仅仅对 train_targets 进行 fit_transform,然后只 transform 的 non_train_targets。

上手 HyperparameterHunter

好了,别再拖延。如何在 HyperparameterHunter 中完成这些吧。

但是,Hunter 中定义特征工程步骤的语法是如此的顺畅和合乎逻辑!我从来没想过 HyperparameterHunter 会以我早在使用的格式期待它们!真是太疯狂了!但是那又如何呢???

—你(也许你会这么说)

好了,亲爱的读者,秘密的成分就是上面写到的那些函数,尤其是那些输入的参数命令。我么将这些函数叫做 EngineerStep 函数,因为每个函数都是一个工程步骤。一个 FeatureEngineer 在这里仅仅是一个 EngineerSteps 的列表或者函数。

回到秘密成分上。一个 EngineerStep 函数仅仅是一个普通的函数,你可以在其中做任何你想做的数据处理。只需要在输入参数中告知想要处理的数据就行。精明的读者或许已经注意到了上面提到的 EngineerStep 函数的模式,但是为了记住合规的 EngineerStep 函数参数,这里有一个有效的公式。

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从第一个集合中拿一个字符串,将第二个集合中的一个字符串连接在它后面,然后你就得到了一个合规的 EngineerStep 函数参数。另一个重要的部分就是函数返回的结果。幸好这个更加容易记住。返回的是函数的新值。你还可以选择返回变换器来执行逆目标变换,就像我们上面的 quantile_transform 一样。

还有两个别名来组合数据以便于处理,我们已在上面的函数中使用过这些别名了。让我们更新一下这个高度复杂和细致入微的公式,以添加额外的 EngineerStep 函数参数别名:

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正如新参数的名称所暗示的那样,「all_inputs」/「all_targets」为你提供了所有数据集输入/目标的大型 DataFrame。「non_train_inputs」和「non_train_targets」类似,只是它们省略了所有训练数据。每个公式下面的注释都提醒「test_inputs」没有目标对应参数,因为我们不按设计跟踪测试目标。

进一步了解

有了对如何创建特征工程步骤的新认识,现在开始在 CVExperiment 中使用特征工程吧。

在 CVExperiment 中仅仅需要 feature_engineer kwarg,或者任何 OptPro 的 forge_experiment 方法。feature_engineer 可以是一个 FeatureEngineer 实例,或者是 EngineerSteps/函数的列表,就像我们上面定义过的那些一样。

hyperparameter_hunter package地址:https://hyperparameter-hunter.readthedocs.io/en/latest/source/hyperparameter_hunter.html#hyperparameter_hunter.EngineerStep

实验部分

还记得基线在 OOF 数据上达到了中位数为 0.51 的绝对误差中值吗。现在可以用一些 FeatureEngineer 增强的 CVExperiments 模型做一些测试,看看会发生什么...

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让我们分析一下发生了什么。三个不同的 CVExperiment,每个都使用了不同的 FeatureEngineer,实验 #1 和基线实验的性能一样。实验 #2 稍微好一些。实验 #3 说明误差从 0.51 降到 0.46。或许现在可以说 quantile_transform 就是最好的特征工程步骤,然后就完事了。但是我们如何能够确定呢?

首先面对的是优化

在 CVExperiment 中使用 FeatureEngineer 是非常棒的。让 HyperparameterHunter 的 OptPros 来为测试特征工程步骤的不同组合甚至会有更好的效果。

读者可能会担心,增加优化步骤必然会使特征工程复杂化。但是不必担心,因为仅仅需要使用 OptPros 的 forge_experiment 方法,这就像在初始化一个 CVExperiment。

为了在不同 EngineerSteps 组成的空间内进行搜索,只需将这些步骤放在 Categorical 内部,像是标准的 超参数 优化一样。想尝试一个特别值得怀疑的 EngineerStep 时,Categorical 也有一个可选择的 kwarg。如果 optional = True(默认值= False),则搜索空间不仅包括显式给出的 Categorical,还包括完全省略当前的 EngineerStep。

在做特征优化之前,需要更多的 EngineerStep 函数来做优化。也许读者希望尝试一些 standard_scale 之外的其他的缩放方法。我们可以先来先定义一下 min_max_scale 和 normalize 的相关方法。

请注意,在经典的 HyperparameterHunter 中,我 OptPro 会自动发现上面的 4 个实验与我们的搜索空间是兼容的,并且将它们作为学习材料来实现快速启动优化。

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蓝色矩形中添加了通过 OptPro 实现的一些新实验的分数。

每当 OptPros 发现一个实验具有比当前最好的结果更高的分数,它就会将这个得分标为粉红色,将它的 超参数 标为绿色。通过 16 次实验,OptPro 只是刚刚预热,但 quantile_transform 看起来很有希望。此外,似乎尝试一些不同的缩放器可能会得到更好的结果,毕竟我们新的最佳实验使用最近添加的 min_max_scale 方法,而不是 standard_scale。

回到源头

现在,让我们回到我们的根源。我们希望把我们新的特征优化技术和一些经典的 超参数 优化混合起来,因为没人愿意陷在局部最优里面。

除了增加经典的 超参数 优化之外,让我们假装自信一些——euclidean_norm 是重要的 (尽管它实际上似乎并非如此),通过删除包含它的 Categorical,让它变成一个必需的 EngineerStep。请注意,这个变化意味着我们的 OptPro 将会仅仅从 16 个候选实验中的 8 个已经保存的实验中学习,因为我们限制了搜索空间。

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quantile_transform 继续执行没有目标的转换,但是让我们在 power_transform 中添加一些真正的竞争。

我们还可以通过把 BayesianOptPro 切换成 RandomForestOptPro(或者任何其他的 OptPro)来得到另一种观点。看一下我们上面的实验,貌似 normalize 并不是做得十分好,所以我们放弃它吧。实际上,让我们假设,确定想要的是 standard_scale 或者 min_max_scale,所以我们将会从这种混合中删除 normalize,并在我们的第二个 EngineerStep 中删除 optional=True 的部分。

因为我们有些过于热情的决定 euclidean_norm 很重要的一件事,所以让我们再次选择第一个 EngineerStep 吧。当然,我们还需要添加 power_transform 作为我么最后一个 EngineerStep 的选择。

总之,下面的 OptPro 将会修改上面的三个 EngineerSteps,作为一种改变,我们将会尝试 RandomForestOptPro。

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尽管改变了整个 FeatureEngineer 的空间,甚至需要一个新的 OptPro 来运行整个过程,我们还是能够从 26 个保存的候选者中识别出 16 个匹配的实验,这些实验可以用作跳跃式优化。可以说,这要比开始的时候好很多。

更好的是,我们有一个新的最佳实验了,它将结果提升到了 0.37 的 MAE,没有做任何的特征工程,从基线的 0.51 上降了下来。

现在,你这只美丽的孔雀,起飞吧!

这些结果的神奇之处就是它们都会保存在你计算机本地,这意味着你可以持续使用好多天、好几星期、好几年,甚至好几代人。好了,也许这不是最后一部分。

关键在于当你从这个小问题开始,朝着构建一个需要训练好多时间的模型开始的时候,你为何要满足于重新运行相同的模型呢?或者从过去的实验中攫取有价值的信息,或者手动地追踪所有这些荒谬的 超参数 和特征工程呢?

展开你的翅膀,让 HyperparameterHunter 来处理这些烦人的琐事吧,这样你就可以不再去跟踪这一切了,可以将你的时间花在机器学习上了。

原文链接: https://towardsdatascience.com/hyperparameter-hunter-feature-engineering-958966818b6e


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